Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms