Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms