Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC174Q6PII3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms