Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms