Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms