Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC01482-201ENST00000585484 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 HNRNPH3P1-201ENST00000431935 583 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL133415.1-201ENST00000456355 706 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC008429.1-201ENST00000520067 966 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC112236.1-201ENST00000561977 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CNTNAP3P5-201ENST00000611892 888 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AC097534.2-203ENST00000609900 1921 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AL445675.1-201ENST00000603868 1410 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C4orf48Q5BLP8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms