Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms