Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK3Q16288 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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