Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TCEA2Q15560 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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