Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PUM3Q15397 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PUM3Q15397 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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