Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms