Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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