Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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