Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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