Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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