Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK18Q07002 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms