Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms