Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms