Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms