Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
RPS29P62273 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
RPS29P62273 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms