Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms