Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms