Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms