Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDHBP21953 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms