Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB1P16220 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms