Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHGAP10645 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHGAP10645 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHGAP10645 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms