Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DQB1P01920 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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