Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKAP2O75563 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms