Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPAG9O60271 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPAG9O60271 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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