Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GOLGA8SH3BPF8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms