Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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