Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF839A8K0R7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms