Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RGPD3A6NKT7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms