Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms