Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HHLA3Q9XRX5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms