Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XCL2Q9UBD3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms