Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHPF2Q9P2E5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHPF2Q9P2E5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms