Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms