Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARHGEF38Q9NXL2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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