Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms