Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF7Q9BWX1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms