Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFHD1Q9BUP0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms