Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM56Q9BRZ2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms