Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms