Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms