Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms