Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms