Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CDY6P-201ENST00000413320 1266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GAMTP2-201ENST00000430917 463 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC009948.2-201ENST00000437039 713 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC099541.1-201ENST00000453828 670 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC068620.1-201ENST00000470544 798 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL309P-201ENST00000491364 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PINX1-203ENST00000519088 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC021678.2-201ENST00000521731 887 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF175-203ENST00000545217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D21-203ENST00000562056 965 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC009088.4-201ENST00000575892 280 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL662791.5-202ENST00000623946 461 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms