Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms