Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms